Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTAP01374 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTAP01374 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTAP01374 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTAP01374 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LTAP01374 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LTAP01374 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTAP01374 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms