Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VIPP01282 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VIPP01282 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VIPP01282 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VIPP01282 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VIPP01282 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VIPP01282 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VIPP01282 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VIPP01282 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VIPP01282 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VIPP01282 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIPP01282 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIPP01282 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VIPP01282 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIPP01282 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIPP01282 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VIPP01282 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms