Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN9O95484 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN9O95484 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms