Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAPBO95292 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAPBO95292 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VAPBO95292 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAPBO95292 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAPBO95292 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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