Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSTN1O94985 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms