Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOBTB3O94955 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOBTB3O94955 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms