Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRIG2O94898 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRIG2O94898 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms