Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCATO75600 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCATO75600 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCATO75600 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCATO75600 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCATO75600 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCATO75600 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCATO75600 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCATO75600 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCATO75600 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCATO75600 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCATO75600 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCATO75600 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCATO75600 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCATO75600 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCATO75600 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCATO75600 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCATO75600 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCATO75600 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCATO75600 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCATO75600 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCATO75600 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCATO75600 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms