Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBNO60934 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NBNO60934 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NBNO60934 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NBNO60934 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NBNO60934 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NBNO60934 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NBNO60934 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBNO60934 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBNO60934 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBNO60934 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBNO60934 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBNO60934 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBNO60934 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBNO60934 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBNO60934 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBNO60934 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBNO60934 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NBNO60934 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NBNO60934 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBNO60934 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBNO60934 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NBNO60934 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms