Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3BO60391 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN3BO60391 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms