Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KIF1CO43896 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KIF1CO43896 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms