Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms