Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYNGR1O43759 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYNGR1O43759 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms