Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERI3O43414 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERI3O43414 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERI3O43414 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERI3O43414 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERI3O43414 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERI3O43414 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERI3O43414 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERI3O43414 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERI3O43414 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms