Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DYNC1LI2O43237 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DYNC1LI2O43237 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms