Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSH5O43196 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSH5O43196 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MSH5O43196 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
MSH5O43196 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MSH5O43196 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSH5O43196 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSH5O43196 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSH5O43196 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSH5O43196 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSH5O43196 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms