Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
DCLK1O15075 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK1O15075 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms