Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP1O00294 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP1O00294 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TULP1O00294 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP1O00294 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP1O00294 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP1O00294 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TULP1O00294 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TULP1O00294 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms