Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGRMC1O00264 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGRMC1O00264 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms