Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVH48-1M5A8F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVH48-1M5A8F1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms