Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3QKU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3QKU1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
J3QKU1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3QKU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
J3QKU1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3QKU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3QKU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3QKU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3QKU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms