Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF26H0Y7S4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF26H0Y7S4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms