Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LMO7DNF2Z398 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms