Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF28PB7ZC32 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF28PB7ZC32 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms