Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DEV8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DEV8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DEV8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DEV8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DEV8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DEV8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DEV8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DEV8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DEV8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
B4DEV8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
B4DEV8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
B4DEV8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DEV8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DEV8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms