Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB1P1B2RPK0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGB1P1B2RPK0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms