Protein–RNA interactions for Protein: B1AHC4

PRR5-ARHGAP8, PRR5-ARHGAP8 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms