Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC85CA6NKD9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC85CA6NKD9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms