Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01546A6NGU7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms