Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNDIG1LA6NDD5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms