Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSDA5PKW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSDA5PKW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms