Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GSAPA4D1B5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GSAPA4D1B5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms