Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
IRGMA1A4Y4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRGMA1A4Y4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms