Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ERBB2-218ENST00000584450 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAIM2-201ENST00000320634 4654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CARD8-221ENST00000521613 1903 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IGSF1-203ENST00000370901 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF503-AS1-202ENST00000524517 790 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KCNE4-201ENST00000281830 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NUTM2A-AS1-205ENST00000420424 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HMGN3-AS1-201ENST00000604516 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 OR10N1P-203ENST00000641736 1305 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CCDC174-201ENST00000303688 2714 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CAPN3-203ENST00000349748 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SMAD9-201ENST00000350148 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PAMR1-205ENST00000611014 2613 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SEH1L-201ENST00000262124 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ARMC8-221ENST00000491704 2777 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IL7-201ENST00000263851 2076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DPPA2-201ENST00000478945 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DNAI2-205ENST00000579490 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CDH4-202ENST00000611855 3304 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LSAMPQ13449 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms