Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRJQ12913 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRJQ12913 AC019254.1-202ENST00000558515 645 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRJQ12913 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRJQ12913 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRJQ12913 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRJQ12913 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPRJQ12913 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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