Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LILRA2-202ENST00000251377 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TNFSF13B-202ENST00000430559 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DIO1-202ENST00000361921 1861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MRPL45-204ENST00000619548 1554 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PGC-204ENST00000425343 1152 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC092944.1-204ENST00000475102 384 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC092327.1-201ENST00000596612 744 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 BHLHB9P1-201ENST00000553845 1651 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ZNF132-201ENST00000254166 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NDRG4-203ENST00000394279 3431 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KRT18P26-201ENST00000454475 1281 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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