Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 C11orf1-201ENST00000260276 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 POTEB-202ENST00000439682 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LRRC63-202ENST00000446175 2114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms