Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 WDR78-201ENST00000371022 1520 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AC008663.2-201ENST00000517299 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 AL627309.3-201ENST00000495576 1319 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TMEM100-205ENST00000575734 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LMO3Q8TAP4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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