Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HECTD4Q9Y4D8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HECTD4Q9Y4D8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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