Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKP3Q9Y446 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKP3Q9Y446 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKP3Q9Y446 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms