Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRG3Q9Y2Y8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRG3Q9Y2Y8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms