Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED16Q9Y2X0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms