Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG6Q9Y2V7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COG6Q9Y2V7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms