Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL20Q9Y2M5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL20Q9Y2M5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms