Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFR3BQ9Y2G0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFR3BQ9Y2G0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFR3BQ9Y2G0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms