Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HIGD1AQ9Y241 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIGD1AQ9Y241 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms