Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHOC2Q9UQ13 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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