Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPS5Q9UPZ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HPS5Q9UPZ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HPS5Q9UPZ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms