Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SATB2Q9UPW6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SATB2Q9UPW6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms