Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAL4Q9UM19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAL4Q9UM19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms